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孟盈教授团队在黄精属系统基因组学和分化模式研究中取得重要成果

发布时间:2023年12月01日     作者:      点击量:[]


 

    天博官方网站孟盈教授团队通过Hyb-seq基因组测序技术解析北温带黄精属(天门冬科黄精族)的系统基因组学及演化模式,为重建北温带植物区系的进化关系和物种形成模式提供了重要的参考。近日,该成果在进化生物学及分子系统发育学的经典期刊《Molecular Phylogenetics and Evolution》发表(IF=4.1,中科院一区top)。

    黄精属是黄精族中最大的属,广泛分布于北半球温带地区,以我国西南和亚洲东北部为多样化中心。黄精属的许多物种具有重要的药用和观赏价值,因而对于本属植物的分类和系统发育研究由来已久,但其属下许多物种的系统发育关系仍然有争议。本研究利用Hyb-Seq基因富集获得了黄精属及其近缘类群43种的515个单拷贝核基因和叶绿体全基因组数据。由这些单拷贝核基因和叶绿体序列构建的系统发育树有力地支持黄精属的单系性,并划分为三个主要分支。核基因组树和叶绿体树之间以及属内基因树之间存在明显的冲突,但所有冲突都发生在每个主要分支内。这些冲突会模糊物种间真实的系统演化关系,为了探明造成这些冲突背后的原因,本文利用多个软件进行检测分析。基因渗入检测表明黄精属内的基因流水平低,基因渗入事件弱;网状指数(Reticulation Index)分析表明系统估算错误是造成基因树和物种树进化冲突的主要原因,这可能是由于黄精属植物以根状茎无性繁殖为主,基因变异小,进化速率慢所导致的。

 

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